ДНК — это текст: израильские ученые соединили лингвистику и генетику.

Новые научные открытия часто происходят благодаря новаторским и нетрадиционным подходам к исследованиям. Биохимик-вычислитель из Университета Бен-Гуриона в Негеве доктор Барак Акабаев решил исследовать репликацию ДНК с лингвистической точки зрения.

Как известно, ДНК традиционно представляется группами последовательностей букв, и д-р Акабаев хотел проверить, можно ли получить новые знания, анализируя структуру этих последовательностей. Выводы его исследования были недавно опубликованы в престижном научном журнале Nucleic Acids Research.

Взаимодействия ДНК и белка лежат в основе живых клеток, и их понимание может привести к способности контролировать их репликацию. Доктор Акабаев построил алгоритм машинного обучения и обнаружил, что группы букв в ДНК повторяются предсказуемым образом, и что лингвистический анализ группировок раскрывает их функции. Его алгоритм может как идентифицировать важные группы, так и предсказывать будущие группы, что закладывает основу для совершенно нового подхода к разработке лекарств.

Не довольствуясь тем, чтобы полагаться исключительно на теоретические доказательства, д-р Акабаев и его исследовательская группа проверили результаты экспериментально.

«Нам удалось разработать мультидисциплинарный подход, являющийся инновационным на нескольких уровнях, — объясняет д-р Акабаев. — Благодаря разработанному нами инструменту мы можем контролировать специфические взаимодействия между ДНК и белками, опознавая те последовательности ДНК, которые важно точно дублировать до того, как клетка разделится. Я считаю, что мы можем использовать этот подход для планирования новых инновационных лекарств в будущем».

В группу исследователей входили аспиранты Университета им. Бен-Гуриона Адам Софер, Сара Эйсдорфер, Мория Ифрах, Стефан Илич, Ариэль Афек, Алель Шуссхейм и доктор Дан Виленчик из Школы компьютерной и электротехнической инженерии.

Д-р Акабаев является сотрудником химического отделения факультета естественных наук и исследовательского центра Data Science Research Center Университета им. Бен-Гуриона. Его исследование было поддержано Израильским научным фондом.

ПОЛИТИКА 2.0

Телеграм-канал информационно -аналитического агентства ПОЛИТИКА 2.0

https://t.me/politics_2_0