Дешевый тест «Гармония» легко обнаруживает геном коронавируса без ПЦР

Хотя тесты ПЦР очень точны, основным ограничением является то, что тесты ПЦР требуют десятков циклов нагревания и охлаждения для обнаружения генетического материала в образце. Тест, разработанный командой UW, обходит эту проблему.

Исследователи из Вашингтонского университета разработали новый тест на COVID-19, который сочетает в себе скорость безрецептурных тестов на антигены с точностью ПЦР-тестов, которые обрабатываются в медицинских лабораториях и больницах.

Тест Harmony COVID-19 — это диагностический тест, который, как и ПЦР-тесты на COVID-19, обнаруживает генетический материал вируса SARS-CoV-2. Но в то время как обычные тесты ПЦР могут занять несколько часов, набор Harmony может предоставить результаты менее чем за 20 минут для некоторых образцов и с аналогичной точностью.

«Мы разработали тест так, чтобы он был недорогим и достаточно простым, чтобы его можно было использовать где угодно», — сказал Барри Лутц, адъюнкт-профессор биоинженерии Университета Вашингтона и исследователь Института точной медицины Бротмана Бэти. «Мы надеемся, что низкая стоимость сделает высокопроизводительное тестирование более доступным на местном уровне и во всем мире».

Лутц является старшим автором статьи, опубликованной 15 декабря в журнале Science Advances , в которой описывается набор для тестирования Harmony COVID-19. Исследователи разработали Harmony, чтобы он был простым и удобным в использовании, используя готовые к использованию реагенты. В тесте используется «подобный ПЦР» метод для обнаружения присутствия генома РНК SARS-CoV-2 в образце мазка из носа с помощью небольшого недорогого детектора, который также был разработан группой Лутца. Смартфон используется для управления детектором и считывания результатов. Детектор может обрабатывать до четырех образцов одновременно и помещается в бардачок стандартного автомобиля.

Точность тестов на COVID-19 была насущной проблемой на протяжении всей пандемии. Многие домашние наборы антигенов для COVID-19, которые обнаруживают фрагменты белков, которые создает вирус вместо своего генетического материала, имеют точность 80-85%, хотя точность может снизиться с вариантом Omicron, который содержит относительно большое количество мутаций. Не встречается у других штаммов. ПЦР-тесты, как правило, имеют точность 95% или лучше — ключевой показатель FDA — но требуют дорогостоящего оборудования и длительного ожидания результатов.

Первоначальные результаты, представленные в статье, показывают, что точность набора Harmony для мазков из носа составляет 97%. Набор Harmony обнаруживает три разных участка генома вируса. Если новый вариант имеет много мутаций в одной области, новый тест все еще может обнаружить две другие. Он может, например, обнаружить вариант Омикрон, который имеет десятки мутаций в области генома, кодирующей так называемый шиповидный белок.

Хотя тесты, основанные на ПЦР или полимеразной цепной реакции, очень точны, основным ограничением является то, что тесты ПЦР требуют десятков циклов нагревания и охлаждения для обнаружения генетического материала в образце. Тест, разработанный командой UW, обходит эту проблему, полагаясь на метод, подобный ПЦР, известный как RT-LAMP, который не имеет таких строгих требований к температурным циклам.

Источник