Вопросы микробиома плода иллюстрируют подводные камни микробных исследований с низкой биомассой

Вопрос о том, устойчиво ли плод человека и пренатальная внутриутробная среда (амниотическая жидкость и плацента) колонизируются микробными сообществами при здоровой беременности, остается предметом дискуссий. Здесь мы оцениваем недавние исследования, которые охарактеризовали микробные популяции у плодов человека с точки зрения репродуктивной биологии, микробной экологии, биоинформатики, иммунологии, клинической микробиологии и гнотобиологии, а также оцениваем возможные механизмы, с помощью которых плод может взаимодействовать с микроорганизмами. Наш анализ показывает, что обнаруженные микробные сигналы, вероятно, являются результатом загрязнения во время клинических процедур для получения образцов плода или во время выделения ДНК и секвенирования ДНК. Более того, существование живых и размножающихся микробных популяций в здоровых тканях плода несовместимо с фундаментальными концепциями иммунологии, клинической микробиологии и выводом безмикробных млекопитающих. Эти выводы важны для нашего понимания иммунного развития человека и иллюстрируют распространенные ловушки в микробных анализах многих других сред с низкой биомассой. Поиск эмбрионального микробиома служит предупреждающим примером проблем исследований микробиома на основе последовательностей, когда биомасса низкая или отсутствует, и подчеркивает необходимость междисциплинарного подхода, который выходит за рамки контроля загрязнения, а также включает биологические, экологические и механистические факторы. концепции. Эти выводы важны для нашего понимания иммунного развития человека и иллюстрируют распространенные ловушки в микробных анализах многих других сред с низкой биомассой. Поиск эмбрионального микробиома служит предупреждающим примером проблем исследований микробиома на основе последовательностей, когда биомасса низкая или отсутствует, и подчеркивает необходимость междисциплинарного подхода, который выходит за рамки контроля загрязнения, а также включает биологические, экологические и механистические факторы. концепции. Эти выводы важны для нашего понимания иммунного развития человека и иллюстрируют распространенные ловушки в микробных анализах многих других сред с низкой биомассой. Поиск эмбрионального микробиома служит предупреждающим примером проблем исследований микробиома на основе последовательностей, когда биомасса низкая или отсутствует, и подчеркивает необходимость междисциплинарного подхода, который выходит за рамки контроля загрязнения, а также включает биологические, экологические и механистические факторы. концепции.